Vrijwel alle leerlingen van De Brouwerij worden voor hun specifieke problematiek behandeld door één van onze partners: de O.G. Heldringstichting, het Dr. Leo Kannerhuis, Karakter of Eleos. In de meeste gevallen melden zij dan ook de leerlingen aan. Is dat niet het geval, dan kunnen ouders/verzorgers contact opnemen met de locatiedirecteur of de intern begeleider van de locatie.
Iedere locatie van De Brouwerij heeft een Commissie van Begeleiding. Deze commissie bekijkt onder andere in welke groep de leerling het best op zijn plek is. Leerlingen kunnen het hele jaar instromen.